近年來，中種集團集中力量建設規?；?、標準化、集約化和機械化的優勢生產加工基地，實施種子生產“布局區域化、生產標準化、加工專業化”的規范管理，大幅提高種子生產效率、生產質量和抗風險能力，為保障供種安全提供了有力支撐。

中種集團于1996 年率先進駐河西走廊地區，整合西北地區優勢資源，首創“公司+基層政府+農民協作組+農戶”的基地管理模式，實現了規?；品N，推動了我國制種產業水平的提升。近20年來，中種集團不斷完善生產管理體系，創新基地管理模式，充分發揮與億萬農戶合作的經驗優勢，鞏固老基地，拓展新基地，穩定種子生產。目前，中種集團在全國各地擁有數十萬畝穩定的生產基地，初步形成了覆蓋東北、西北、西南、黃淮、長江中下游流域和華南的六大生產基地帶的整體布局。

為順應農業生產經營方式的轉變，在政府支持和農民自愿的前提下，中種集團在甘肅省張掖市和四川省眉山市分別開展規模制種基地流轉試點工作，其中在張掖市流轉土地6000余畝，并與當地村社、農民合作組織和制種大戶結成戰略聯盟，探索了一條“公司+流轉基地+專業合作組織+專業制種大戶”的新生產模式，推動了制種產業的轉型升級。

結合制種基地的戰略布局，中種集團在全國范圍內已建成15個種子加工中心，年生產加工種子2.5億公斤（含參控股企業）。中種集團在云南石林、甘肅臨澤、四川綿陽等基地建設現代化種子加工儲運中心，采用國際先進的種子加工工藝與設施裝備，使種子質量和產能得以大幅提升。